主系列动画中，说到武藏的谜拟丘的话，实际上武藏在很长一段时间里都没有真正驯服谜拟丘，虽然说是收服到了它，但是谜拟丘如果没有皮卡丘在的话就没有什么对战意志，就算皮卡丘在有时候也会因为太过亢奋而吧事情搞砸，所以可以发现其实谜拟丘都没有怎么去真正听从武藏的命令，要说武藏和谜拟丘的关系缓和，动画则有专门的一集来进行描述。
在这一集中，火箭队三人组在宝可梦学校埋伏并打算抓皮卡丘，本来小智打算让鬃岩狼人发动岩石属性的Z招式，但因为还不熟练的缘故发动失败，火箭队三人组则被卡奇打飞，因为穿着熊没有及时赶到，武藏和谜拟丘掉到了好奥乐市的一个商场附近，武藏发现谜拟丘平时用来伪装的外皮破损了，根据喵喵的说法，谜拟丘的真身非常恐怖，是万万看不得的，所以武藏最终用买马拉萨达（马拉萨达被黑暗鸦吃掉了）的包装纸临时当作谜拟丘的外皮。
帮谜拟丘缝补外皮：
因为钱包在武藏的身上，所以武藏可以放肆购物，她也带着谜拟丘到商场里换了各种各样其它的装扮，但是谜拟丘很明显都不满意，武藏看到了谜拟丘对皮卡丘外皮的执着，决定帮谜拟丘缝补外皮，同时和谜拟丘分享马拉萨达，也可能正是这个举动，让谜拟丘开始正视武藏。
武藏和谜拟丘：
后来黑暗鸦又来抢马拉萨达，武藏和黑暗鸦搏斗成功抢回了马拉萨达以及顺便被黑暗鸦顺走的谜拟丘的皮卡丘外皮，在谜拟丘认可了武藏之后，终于听从武藏的命令并赶跑了黑暗鸦，但即便如此，在后续武藏再去找小智对战的时候，谜拟丘还是出现了不听从命令的情况，大概率看到皮卡丘还是会过分亢奋，而最后小智的鬃岩狼人也使用Z招式成功并将火箭队三人组打飞。